Poly Technic Lab

Wyniki konkursu na stanowisko student/stypendysta w projekcie „Metaboliczne biomarkery raka prostaty” (NCN OPUS-29, nr umowy UMO-2025/57/B/NZ7/00041).
Komisja Konkursowa ogłasza, że zwycięzcą konkursu jest Pani Wiktoria Krukar

Wyniki konkursu na stanowisko doktorant/stypendysta w projekcie „Metaboliczne biomarkery raka prostaty” (NCN OPUS-29, nr umowy UMO-2025/57/B/NZ7/00041).
Komisja Konkursowa ogłasza, że zwycięzcą konkursu jest Pani mgr inż. Wiktoria Szuberla

🇺🇸
This week, we have the pleasure of hosting a young scientist from Italy. Let him tell us in his own words what he does here:

"I'm Alessandro De Rosa, a PhD student from Università Suor Orsola Benincasa. (Italy) I'm currently in my third year of Doctoral studies, having devoted most of my research to the characterization of the biodeterioration phenomena affecting outdoor archaeological sites. My focus is mainly devoted to the Archaeological Park of Baia's Thermae as a model site, and to-induced degradation caused by phototrophic communities. Having had the chance to spend six months in Poland to work on the identification, description and characterization of novel green biocides for the mitigation of algae-induced biodeterioration, I'm spending some time at the Rzeszow University of Technology, working with Prof. Tomasz Ruman's Team, to obtain metabolomic spectra of the algal consortia I've been working with. The aim is to check how the metabolomic profiles of these communites shift between samples exposed to different essential oils in time. While here, I'm also working on obtaining metabolomic profiles from biofilm-covered stone environmental samples I collected in Baia's Thermae, in order to confront this data with metabarcoding taxonomic inferences, and hopefully hightlight a simmetry between taxonomic and functional biological patterns. A thousand thanks to the team of Prof. Tomasz Ruman for helping me in what for me is an absolutely new but extremely captiving journey."

🇵🇱
W tym tygodniu mamy przyjemność gościć młodego naukowca z Włoch. Niech swoimi słowami opowie co tu robi:

"Nazywam się Alessandro De Rosa, i jestem doktorantem na Uniwersytecie Suor Orsola Benincasa w Neapolu (Włochy). Obecnie jestem na trzecim roku studiów doktoranckich, a większość moich badań poświęciłem charakterystyce zjawisk biodeterioracji wpływających na zewnętrzne stanowiska archeologiczne. Skupiam się głównie na Parku Archeologicznym Term Baia jako stanowisku modelowym oraz na degradacji indukowanej przez zbiorowiska fototroficzne. Po sześciu miesiącach spędzonych w Polsce, gdzie pracowałem nad identyfikacją, opisem i charakterystyką nowych zielonych biocydów do łagodzenia biodeterioracji indukowanej przez glony, spędzam trochę czasu na Politechnice Rzeszowskiej, pracując z zespołem prof. Tomasza Rumana, aby uzyskać dane metabolomiczne konsorcjów glonów. Pracuję również nad uzyskaniem profili metabolomicznych z próbek środowiskowych pokrytych biofilmem, które zebrałem w Termach Baia, aby porównać te dane z metakodowaniem DNA. Tysiąckrotne podziękowania dla zespołu prof. Tomasza Rumana za pomoc w tej, dla mnie zupełnie nowej, ale niezwykle wciągającej podróży."

Wydział Chemiczny Politechniki Rzeszowskiej
Politechnika Rzeszowska im. Ignacego Łukasiewicza
Katedra Biotechnologii Środowiskowej

🇺🇸
𝗙𝗶𝗿𝘀𝘁 𝗯𝗯𝗖𝗜𝗗 𝗔𝗽𝗽𝗹𝗶𝗰𝗮𝘁𝗶𝗼𝗻 𝗶𝗻 𝗠𝗦𝗜

In one of our recent publications, we demonstrated the first application of the bbCID measurement method in mass spectrometry imaging (MSI). We combined bbCID with the LARAPPI/CI system, enabling simultaneous acquisition of full-scan MS and fragmentation spectra for thousands of compounds in a single experiment — without the need to select specific precursor ions.

This approach simplifies metabolite identification, requires no additional MS/MS steps, and fits well with fast imaging workflows.

We tested the method on human bladder and kidney cancer tissues, comparing tumor and non-tumor regions. By generating parallel precursor and fragment ion maps, we were able to reliably confirm differences in the spatial distribution of several metabolites, including fatty acids, proline, creatine, and serine.

Overall, this solution expands the identification capabilities of MSI and streamlines the analysis of untargeted metabolomic data.

The paper was published in the ACS Journal of the American Society for Mass Spectrometry https://pubs.acs.org/doi/10.1021/jasms.5c00045

This research was supported by SONATA BIS grant no. 2022/46/E/ST4/00016, funded by the National Science Centre.

🇵🇱
𝗣𝗶𝗲𝗿𝘄𝘀𝘇𝗲 𝘇𝗮𝘀𝘁𝗼𝘀𝗼𝘄𝗮𝗻𝗶𝗲 𝗯𝗯𝗖𝗜𝗗 𝘄 𝗼𝗯𝗿𝗮𝘇𝗼𝘄𝗮𝗻𝗶𝘂 𝗠𝗦𝗜

W jednej z naszych ostatnich publikacji pokazaliśmy pierwsze zastosowanie metody pomiarowej bbCID w obrazowaniu spektrometrią mas (MSI). Połączyliśmy bbCID z systemem LARAPPI/CI, dzięki czemu podczas jednego eksperymentu można równocześnie zbierać widma MS i oraz widma fragmentacyjne dla tysięcy związków jednocześnie — bez konieczności wybierania konkretnych prekursorów.

Takie podejście ułatwia identyfikację metabolitów bez dodatkowych kroków i pasuje do szybkich eksperymentów obrazowania.

Przetestowaliśmy metodę na tkankach ludzkiego raka pęcherza i raka nerki, porównując obszary nowotworowe i zdrowe. Dzięki jednoczesnym mapom prekursorów i fragmentów mogliśmy wiarygodnie potwierdzić różnice w rozmieszczeniu m.in. kwasów tłuszczowych, proliny, kreatyny i seryny.

To rozwiązanie rozszerza możliwości identyfikacyjne MSI i upraszcza pracę z nieukierunkowanymi danymi metabolomicznymi.

Publikacja ukazała się w specjalistycznym czasopiśmie wydawnictwa ACS Journal of the American Society for Mass Spectrometry https://pubs.acs.org/doi/10.1021/jasms.5c00045

Badania wykonano w ramach grantu SONATA BIS nr 2022/46/E/ST4/00016 finansowanego przez Narodowe Centrum Nauki

Politechnika Rzeszowska im. Ignacego Łukasiewicza Wydział Chemiczny Politechniki Rzeszowskiej

🎉 Nowa publikacja naukowa naszego zespołu! 🧪🩸🧬

Z dumą informujemy o naszej najnowszej pracy opublikowanej w czasopiśmie Metabolomics:
„Untargeted metabolomic profiling of serum and urine in kidney cancer: a non-invasive approach for biomarker discovery”
🔗 https://doi.org/10.1007/s11306-025-02294-4

W badaniu przeprowadzonym we współpracy pomiędzy Oddziałem Urologii Szpitala w Kolbuszowej oraz Politechniką Rzeszowską wykorzystaliśmy wysokorozdzielczą spektrometrię mas do analizy metabolomicznej surowicy i moczu pacjentów z rakiem nerki. Wyniki są obiecujące — zidentyfikowaliśmy 31 metabolitów (19 w surowicy, 12 w moczu) o wysokim potencjale diagnostycznym (AUC > 0,90)!

To kolejny krok w kierunku opracowania nieinwazyjnych biomarkerów raka nerki, które mogą w przyszłości wspomagać wczesne wykrywanie choroby i precyzyjne leczenie. 🧠💡

📍Dziękujemy wszystkim pacjentom, zespołowi badawczemu i współautorom:
Anna Ossolińska, Aneta Płaza-Altamer, Krzysztof Ossoliński, Tadeusz Ossoliński, Tomasz Ruman i Joanna Nizioł.