Syngen Biotech

Typowanie HLA

W transplantologii jednym z kluczowych czynników decydujących o powodzeniu przeszczepu jest zgodność immunologiczna między dawcą a biorcą. Układ HLA (Human Leukocyte Antigens) odpowiada za rozpoznawanie własnych i obcych struktur przez układ odpornościowy, dlatego nawet niewielkie różnice w genotypie mogą wpływać na ryzyko odrzucenia przeszczepu.

Z tego powodu precyzyjne typowanie HLA jest jednym z najważniejszych etapów kwalifikacji do transplantacji. Im wyższa rozdzielczość typowania i im bardziej jednoznaczny wynik, tym większa szansa na dobranie optymalnego dawcy oraz na długoterminowy sukces przeszczepu.

Wraz z rozwojem technologii genetycznych zmieniają się również możliwości laboratoriów transplantologicznych. Metody oparte na sekwencjonowaniu nowej generacji pozwalają dziś na znacznie dokładniejsze określenie wariantów HLA, a jednocześnie skracają czas uzyskania wyników – co ma ogromne znaczenie zwłaszcza w sytuacjach pilnych.

Jednym z rozwiązań wykorzystujących najnowsze osiągnięcia w tej dziedzinie jest NanoTYPE™ (Omixon) – zestaw do typowania HLA oparty na technologii sekwencjonowania trzeciej generacji od Oxford Nanopore Technologies.

Zestaw NanoTYPE™ zawiera wszystkie niezbędne odczynniki do amplifikacji próbek oraz dedykowane oprogramowanie do genotypowania NanoTYPER™. System został zaprojektowany do współpracy z szybkim przygotowaniem bibliotek typu rapid barcoding od ONT, co umożliwia sprawne przygotowanie próbek do analizy.

Najważniejsze zalety rozwiązania:

🔬 Jednoczesna amplifikacja 11 loci HLA w pojedynczej reakcji long-range multiplex PCR (HLA-A, HLA-B, HLA-C, HLA-DQA1, HLA-DQB1, HLA-DPA1, HLA-DPB1, HLA-DRB1 oraz HLA-DRB345)
⏱️ Od próbki do sekwencjonowania w mniej niż 4 godziny
🧬 Sekwencjonowanie długich odczytów, umożliwiające lepsze fazowanie SNP i redukcję niejednoznaczności
📊 Dokładność na poziomie 99,8%
⚙️ Uproszczony workflow w porównaniu z klasycznym NGS typu short-read
🔄 Elastyczność pracy – od 1 do 24 próbek w jednym przebiegu

Użytkownik może wybrać jeden z dwóch protokołów pracy:
- szybkie typowanie pojedynczej próbki w trybie pilnym
- analiza wielu próbek w jednym przebiegu

Dzięki szybkiemu czasowi uzyskania wyników, prostemu workflow oraz minimalnym wymaganiom inwestycyjnym, NanoTYPE™ może stanowić zarówno główną metodę typowania HLA, jak i cenne uzupełnienie istniejących technologii w laboratorium.

Technologia nanopore może być kolejnym przełomem w transplantologii – podobnie jak wprowadzenie technologii Luminex zrewolucjonizowało diagnostykę przeciwciał kilkanaście lat temu.